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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

始终用作有机化工工业原料而被所知的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄废弃物”变为“产品小分子式”的辛酸史发展历程似的,终会近二十好久才被知道其核心的生物体学功能表,自此“起身农奴把唱歌”,相当是在免疫力支原体感染性急病钻研的领域内异军突起。已经存在几篇小作文媒体报道了在各项支原体感染性急病的动植物模板中予以衣康酸或其耐腐蚀掩盖繁衍物体的医治益处,并知道其潜在的靶点。更多衣康酸的“前生”与“今世”,具体情况见文案《乳酸的逆袭吧哥们——衣康酸!本文兜兜风知道衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸呈现蛋白质组学产品,实现1000+深奥度突显位点检测出,稳固逆转精选靶点,全多方面生信数据分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现”到“证实”全的流程服务于,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、进行实验的流程

02、场地实测统计数据

03、经“点”再现

在实测值统计资料中,验出众多专著中报到的典型靶点和衣康酸装饰位点,如最个被察觉的衣康酸共价装饰血清KEAP1,都有糖酵解环路中的3个最为关键的的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,包括炎性小体包含血清NLRP3和上皮细胞烂掉历程中的最为关键的的血清RIPK3等,其质谱图下列图提示。

04、品牌特征

1.几斤质控

商务化特情人测试探针孵育、SDS-PAGE检查、WB验证通过、范本有关性研究等双坐向检查,确保安全好项目效果靠得住性。

2.高耐磨性质谱测试仪器工作平台

在Orbitrap Astral全新一带高辨别质谱仪火供下,体现衣康过酸遮盖位点及蛋清监定新宽度,动力科学实验实验新发掘。

3.全环节一趟式服务培训

系统设计拜谱生态学全面的工作游戏平台,可展示 “受损细胞的培养→电极孵育→WB在线检测工具→什么难以理解的度衣康酸性反应淡化在线检测工具→个性化生信了解→某位点PRM验证通过”全具体步骤保障,省时杠杆原理更实惠。

05、定性分析知识(这部分)

06、应运方问

PART 2、文章分享图片

期刊论文一

用英文怎么说主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名微信标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探索方式:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

学术论文二

因为一级标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

2英文主题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探究信息内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物双重性基本思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13还具有较差的底物依照水平,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物体衣康酸性反应呈现组试验数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用表达(下述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

对于TCA再循环中的里头分解物,衣康酸调准分解、免役和感染病变之前的主动作用,为治療免役感染病变性疫情给予了使用治療方式。衣康酸框架中的亲电性α,β-不饱满羧酸框架能对氨基酸质含量质上的吸附性半胱氨酸残基通过烷基化体现(迈克尔加上响应),相应全文翻译后体现被又称“衣康酸体现(itaconation)”,因而作用氨基酸质含量质功能表,国家宏观调控免役回复和分解方法,为各种疫情治疗药物产品开发给予新方法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学绝对化酶联免疫法靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或消耗的能量分解靶向治疗分解组品牌对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考资料论文资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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