
近日,东莞医科大时最加盟卫生院王学浩院土团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗激光能量消化吸收检测分析服务。
英文音标宝贝标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文标题格式:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
玩家计量单位:南京医科大学
的研究原料:细胞
拜谱提高的服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物人体脂肪排泄组
能力路线地图:
的研究毕竟
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的根本遗传基因
本学习终端采集HCC肉瘤范例(n=7)的单内部系RNA测序数剧集采取深入了解,察觉糖酵解活力主要的汇聚在肉瘤内部系中,hdWGCNA深入了解分辨出9个基因组模快(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的环境深入了解确实YBX1为自立环境的风险原因(图1H)。进第一步根据IHC、WB科学试验和肉瘤策划 与相临非肉瘤策划 的房间转录组学数剧集灵魂存在YBX1是肝内部系癌中药治疗的不确定性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确实为调低HCC人体细胞糖酵解的根本重要因素
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗动能产生组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1催进HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1组合并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融合并增强YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增进其磷硝化作用,可以有利于促进其核转位
进一次检侧YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要影晌其磷过酸,在OGT敲低的HCC组织体细胞中或用OGT减缓剂OSMI-1解决,YBX1蛋清技术同质性降底,YBX1磷过酸同质性减轻(图4A-C)。IP实验所显视,在雷同的Flag-YBX1底物技术下,YBX1-WT的磷过酸技术同质性高与YBX1-T57A,遇到磷过酸的不断增强并不是仅是是由于更强的YBX1蛋清把你想体现出来(图4D)。分离出来了核和质类物质遇到TMG解决的HCC组织体细胞中YBX1核把你想体现出来的偏高(图4E-F),进一次遇到YBX1磷过酸的至关重要调试指数是AKT(图4G-I)。以上遇到牢固树立O-GlcNAc糖基化借助增进其磷过酸来不断增强YBX1蛋清稳定可靠性并增进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显有助于于其进每一步突发磷酸性反应突显并就可以加速其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推动PKM2转录
06、YBX1 还可以提升组蛋清乳过酸掩盖质量
研发看见YBX1敲低明显影响蛋清酶质乳过酸,更是要格外重视是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解减弱剂2-DG的工作断定了糖酵解与组蛋清酶乳过酸的可以单独绑定,减弱糖酵解可明显影响H3K18la品质(图6D)。PKM2过展现可逆反应转YBX1敲低所导致的的H3K18la的降低,到外源乳酸清理不只增加H3K18la,还周期性YBX1展现调整,信息提示存在的顺向信息反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la使用聚集于YBX1启动时子可以单独力促其转录,该全过程受O-GlcNAc糖基化控制(图6H-J),并看见P300 调整是YBX1增进H3K18乳酰化做用的逻辑(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳酸性反应掩盖水平方向
句子个人总结
在任何分析中通讯稿了YBX1在HCC中高形容,有时候与糖酵解迷切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,而使比较稳定球脂肪酸并提高其形容。此种掩盖还使得YBX1在T57处的磷硝化作用,使得其核易位。因而,此种流程加强了糖酵解有关表观遗传组的转录并促进乳酸的诞生。还有就是,YBX1刺激P300的转录,接着驱动安装组球蛋白酶的乳硝化作用,很大是H3K18la,H3K18乳硝化作用双向调整YBX1表观遗传组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传双面馈环新机制图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物体为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法能源细胞代谢组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、汉语翻译后装饰组学、排泄组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考资料资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.